Nagy Gergely Ármin; Tombácz Dóra; Prazsák István; Csabai Zsolt; Dörmő Ákos; Gulyás Gábor; Kemenesi Gábor; Tóth Gábor Endre; Holoubek Jiří; Růžek Daniel; Kakuk Balázs; Boldogkői Zsolt:
Exploring the transcriptomic profile of human monkeypox virus via CAGE and native RNA sequencing approaches.
mSPHERE, 9 (9).
ISSN 2379-5042
(2024)
Tombácz Dóra; Torma Gábor; Gulyás Gábor; Fülöp Ádám; Dörmő Ákos; Prazsák István; Csabai Zsolt; Mizik Máté Levente; Hornyák Ákos; Zádori Zoltán; Kakuk Balázs; Boldogkői Zsolt:
Hybrid sequencing discloses unique aspects of the transcriptomic architecture in equid alphaherpesvirus 1.
HELIYON, 9 (7).
ISSN 2405-8440
(2023)
Torma Gábor; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Almsarrhad Islam; Nagy Gergely Ármin; Kakuk Balázs; Gulyás Gábor; Spires Lauren McKenzie; Gupta Ishaan; Fülöp Ádám; Dörmő Ákos; Prazsák István; Mizik Máté Levente; Dani Virág Éva; Csányi Viktor; Harangozó Ákos; Zádori Zoltán; Toth Zsolt; Boldogkői Zsolt:
Identification of herpesvirus transcripts from genomic regions around the replication origins.
SCIENTIFIC REPORTS, 13 (1).
ISSN 2045-2322
(2023)
Kakuk Balázs; Dörmő Ákos; Csabai Zsolt; Kemenesi Gábor; Prazsák István; Dani Virág Éva; Dénes Béla; Torma Gábor; Jakab Ferenc; Tóth Gábor Endre; Földes Fanni Vivien; Zana Brigitta; Lanszki Zsófia; Harangozó Ákos; Fülöp Ádám; Gulyás Gábor; Mizik Máté Levente; Kiss András Attila; Tombácz Dóra; Boldogkői Zsolt:
In-depth Temporal Transcriptome Profiling of Monkeypox and Host Cells using Nanopore Sequencing.
SCIENTIFIC DATA, 10 (1).
ISSN 2052-4463
(2023)
Torma Gábor; Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Fülöp Ádám; Prazsák István; Csabai Zsolt; Michael Snyder; Boldogkői Zsolt:
Dual isoform sequencing reveals complex transcriptomic and epitranscriptomic landscapes of a prototype baculovirus.
SCIENTIFIC REPORTS, 12 (1).
ISSN 2045-2322
(2022)
Tombácz Dóra; Dörmő Ákos; Gulyás Gábor; Csabai Zsolt; Prazsák István; Kakuk Balázs; Harangozó Ákos; Jankovics István; Dénes Béla; Boldogkői Zsolt:
High temporal resolution Nanopore sequencing dataset of SARS-CoV-2 and host cell RNAs.
GIGASCIENCE, 11.
ISSN 2047-217X
(2022)
Fülöp Ádám; Torma Gábor; Moldován Norbert; Szenthe Kálmán; Bánáti Ferenc; Almsarrhad Islam A. A.; Csabai Zsolt; Tombácz Dóra; Minárovits János; Boldogkői Zsolt:
Integrative profiling of Epstein–Barr virus transcriptome using a multiplatform approach.
VIROLOGY JOURNAL, 19 (1).
Terjedelem: 17-Azonosító: 7.
ISSN 1743-422X
(2022)
Prazsák István; Csabai Zsolt; Torma Gábor; Papp Henrietta; Földes Fanni Vivien; Kemenesi Gábor; Jakab Ferenc; Gulyás Gábor; Fülöp Ádám; Megyeri Klára; Dénes Béla; Boldogkői Zsolt; Tombácz Dóra:
Transcriptome dataset of six human pathogen RNA viruses generated by nanopore sequencing.
DATA IN BRIEF, 43.
ISSN 2352-3409
(2022)
Torma Gábor; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Mészáros István; Zádori Zoltán; Boldogkői Zsolt:
Combined Short and Long-Read Sequencing Reveals a Complex Transcriptomic Architecture of African Swine Fever Virus.
VIRUSES, 13 (4).
Terjedelem: 21 p-Azonosító: 579.
ISSN 1999-4915
(2021)
Kakuk Balázs; Tombácz Dóra; Balázs Zsolt; Moldován Norbert; Csabai Zsolt; Torma Gábor; Megyeri Klára; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Combined nanopore and single-molecule real-time sequencing survey of human betaherpesvirus 5 transcriptome.
Scientific Reports-Nature, 11 (1).
Terjedelem: 14-Azonosító: 14487.
(2021)
Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Torma Gábor; Nagy Tibor; Hornyák Ákos; Csabai Zsolt; Gulyás Gábor; Boldogkői Zsolt; Jefferson Victoria A.; Zádori Zoltán; Meyer Florencia; Boldogkői Zsolt:
Dynamic Transcriptome Sequencing of Bovine Alphaherpesvirus Type 1 and Host Cells Carried Out by a Multi-Technique Approach.
FRONTIERS IN GENETICS, 12.
Terjedelem: 8 p-Azonosító: 619056.
ISSN 1664-8021
(2021)
Torma Gábor; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Göbhardter Dániel; Deim Zoltán; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
An Integrated Sequencing Approach for Updating the Pseudorabies Virus Transcriptome.
PATHOGENS, 10 (2).
Terjedelem: 21 p-Azonosító: 242.
ISSN 2076-0817
(2021)
Kakuk Balázs; Kiss András Attila; Torma Gábor; Csabai Zsolt; Prazsák István; Mizik Máté; Megyeri Klára; Tombácz Dóra; Boldogkői Zsolt:
Nanopore Assay Reveals Cell-Type-Dependent Gene Expression of Vesicular Stomatitis Indiana Virus and Differential Host Cell Response.
PATHOGENS, 10 (9).
Terjedelem: 12-Azonosító: 1196.
ISSN 2076-0817
(2021)
Csáki Ágnes; Köves Katalin; L. Kiss Anna; Röhlich Pál; Boldogkői Zsolt; Vereczki Viktória; Puskár Zita; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt:
Pinealocytes can not transport neurotropic viruses. Pinealo-to-retinal connection in prepubertal rats originates from pineal neurons: Light and electron microscopic immunohistochemical studies.
NEUROSCIENCE LETTERS, 744.
Terjedelem: 7 p-Azonosító: 135517.
ISSN 0304-3940
(2021)
Maróti Zoltán; Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Torma Gábor; Jefferson Victoria A.; Csabai Zsolt; Gulyás Gábor; Dörmő Ákos; Boldogkői Miklós; Kalmár Tibor; Meyer Florencia; Boldogkői Zsolt:
Time course profiling of host cell response to herpesvirus infection using nanopore and synthetic long-read transcriptome sequencing.
SCIENTIFIC REPORTS, 11 (1).
Terjedelem: 11-Azonosító: 14219.
ISSN 2045-2322
(2021)
Tombácz Dóra; Prazsák István; Torma Gábor; Csabai Zsolt; Balázs Zsolt; Moldován Norbert; Dénes Béla; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Time-Course Transcriptome Profiling of a Poxvirus Using Long-Read Full-Length Assay.
PATHOGENS, 10 (8).
Terjedelem: 17-Azonosító: 919.
ISSN 2076-0817
(2021)
Maróti Zoltán; Tombácz Dóra; Prazsák István; Moldován Norbert; Csabai Zsolt; Torma Gábor; Balázs Zsolt; Kalmár Tibor; Dénes Béla; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Time-course transcriptome analysis of host cell response to poxvirus infection using a dual long-read sequencing approach.
BMC RESEARCH NOTES, 14 (1).
Terjedelem: 7-Azonosító: 239.
ISSN 1756-0500
(2021)
Boldogkői Zsolt; Csabai Zsolt; Tombácz Dóra; Janovák László; Balassa Lilla; Deák Ágota; S. Tóth Péter; Janáky Csaba; Duda Ernő; Dékány Imre:
Visible Light-Generated Antiviral Effect on Plasmonic Ag-TiO2-Based Reactive Nanocomposite Thin Film.
FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY, 9.
Terjedelem: 11-Azonosító: 709462.
ISSN 2296-4185
(2021)
Tombácz Dóra; Prazsák István; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Dénes Béla; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Long-read assays shed new light on the transcriptome complexity of a viral pathogen.
SCIENTIFIC REPORTS, 10 (1).
Terjedelem: 13 p-Azonosító: 13822.
ISSN 2045-2322
(2020)
Olasz Ferenc; Tombácz Dóra; Torma Gábor; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Dörmő Ákos; Prazsák István; Mészáros István; Magyar Tibor; Tamás Vivien; Zádori Zoltán; Boldogkői Zsolt:
Short and Long-Read Sequencing Survey of the Dynamic Transcriptomes of African Swine Fever Virus and the Host Cells.
FRONTIERS IN GENETICS, 11.
Azonosító: 758-Terjedelem: 7 p.
ISSN 1664-8021
(2020)
Moldován Norbert; Torma Gábor; Gulyás Gábor; Hornyák Ákos; Zádori Zoltán; Jefferson Victoria A.; Csabai Zsolt; Boldogkői Miklós; Tombácz Dóra; Meyer Florencia; Boldogkői Zsolt:
Time-course profiling of bovine alphaherpesvirus 1.1 transcriptome using multiplatform sequencing.
SCIENTIFIC REPORTS, 10 (1).
Terjedelem: 14 p.-Azonosító: 20496.
ISSN 2045-2322
(2020)
Csabai Zsolt; Tombácz Dóra; Deim Zoltán; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Analysis of the Complete Genome Sequence of a Novel, Pseudorabies Virus Strain Isolated in Southeast Europe.
CANADIAN JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES & MEDICAL MICROBIOLOGY, 2019.
Paper 1806842-12 p.
ISSN 1712-9532
(2019)
Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Balázs Zsolt; Gulyás Gábor; Csabai Zsolt; Boldogkői Miklós; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Multiple Long-read Sequencing Survey of Herpes Simplex Virus Dynamic Transcriptome.
FRONTIERS IN GENETICS, 10.
Azonosító: 834 -Terjedelem: 20 p.
ISSN 1664-8021
(2019)
Balázs Zsolt; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Template-switching artifacts resemble alternative polyadenylation.
BMC Genomics, 20.
Azonosító: 824-Terjedelem: 10 p.
ISSN 1471-2164
(2019)
Tombácz Dóra; Balázs Zsolt; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Long-read sequencing revealed an extensive transcript complexity in herpesviruses.
FRONTIERS IN GENETICS, 9.
Terjedelem: 6 p.-Közleményazonosító: 259.
(2018)
Prazsák István; Moldován Norbert; Balázs Zsolt; Tombácz Dóra; Megyeri Klára; Szűcs Attila; Csabai Zsolt; Boldogkői Zsolt:
Long-read sequencing uncovers a complex transcriptome topology in varicella zoster virus.
BMC GENOMICS, 19 (1).
Paper 873.-20 p..
ISSN 1471-2164
(2018)
Moldován Norbert; Szűcs Attila; Tombácz Dóra; Balázs Zsolt; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Multi-platform next-generation sequencing identifies novel RNA molecules and transcript isoforms of the endogenous retrovirus isolated from cultured cells.
FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 365 (5).
Terjedelem: 6 p.-Azonosító: fny013.
ISSN 0378-1097
(2018)
Moldován Norbert; Tombácz Dóra; Szűcs Attila; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Multi-platform sequencing approach reveals a novel transcriptome profile in pseudorabies virus.
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 8.
Terjedelem: 13 p.-Azonosító: 2708.
ISSN 1664-302X
(2018)
Moldován Norbert; Tombácz Dóra; Szűcs Attila; Csabai Zsolt; Balázs Zsolt; Kis Emese; Molnár Judit; Boldogkői Zsolt:
Third-generation sequencing reveals extensive polycistronism and transcriptional overlapping in a baculovirus.
SCIENTIFIC REPORTS, 8 (1).
Terjedelem: 11 p.-Azonosító: 8604.
ISSN 2045-2322
(2018)
Tombácz Dóra; Balázs Zsolt; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Szűcs Attila; Sharon Donald; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Characterization of the Dynamic Transcriptome of a Herpesvirus with Long-read Single Molecule Real-Time Sequencing.
SCIENTIFIC REPORTS, 7.
ISSN 2045-2322
(2017)
Póka Nándor; Csabai Zsolt; Pásti Emese; Tombácz Dóra; Boldogkői Zsolt:
Deletion of the us7 and us8 genes of pseudorabies virus exerts a differential effect on the expression of early and late viral genes.
VIRUS GENES, 53 (4).
pp. 603-612.
ISSN 0920-8569, 1572-994X
(2017)
Csabai Zsolt; Takács Irma; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt; Tombácz Dóra:
Evaluation of the impact of ul54 gene-deletion on the global transcription and DNA replication of pseudorabies virus.
ARCHIVES OF VIROLOGY, 162 (9).
pp. 2679-2694.
ISSN 0304-8608
(2017)
Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Balázs Zsolt; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Genetic Adaptation of Porcine Circovirus Type 1 to Cultured Porcine Kidney Cells Revealed by Single-Molecule Long-Read Sequencing Technology.
GENOME ANNOUNCEMENTS, 5 (5).
e01539-16-2 p..
ISSN 2169-8287
(2017)
Tombácz Dóra; Maróti Zoltán; Kalmár Tibor; Csabai Zsolt; Balázs Zsolt; Takahashi Shinichi; Palkovits Miklós; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
High-coverage whole-exome sequencing identifies candidate genes for suicide in victims with major depressive disorder.
SCIENTIFIC REPORTS, 7 (1).
Terjedelem: 11 p-Azonosító: 7106.
ISSN 2045-2322
(2017)
Balázs Zsolt; Tombácz Dóra; Szűcs Attila; Csabai Zsolt; Megyeri Klára; Petrov Alexey N.; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Long-read sequencing of human cytomegalovirus transcriptome reveals RNA isoforms carrying distinct coding potentials.
SCIENTIFIC REPORTS, 7.
Azonosító: 15989-Terjedelem: 9 p..
ISSN 2045-2322
(2017)
Szűcs Attila; Moldován Norbert; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Long-read sequencing reveals a GC pressure during the evolution of porcine endogenous retrovirus.
GENOME ANNOUNCEMENTS, 5 (40).
Azonosító: e01040-terjedelem: 2 p.
(2017)
Moldován Norbert; Balázs Zsolt; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Szűcs Attila; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Multi-platform analysis reveals a complex transcriptome architecture of a circovirus.
VIRUS RESEARCH, 237.
pp. 37-46.
ISSN 0168-1702
(2017)
Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Oláh Péter; Balázs Zsolt; Likó István; Zsigmond Laura; Sharon Donald; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Full-Length Isoform Sequencing Reveals Novel Transcripts and Substantial Transcriptional Overlaps in a Herpesvirus.
PLoS ONE, 11 (9).
Terjedelem: 29 p.-Azonosító: e0162868.
ISSN 1932-6203
(2016)
Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Oláh Péter; Havelda Zoltán; Sharon Donald; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Characterization of novel transcripts in pseudorabies virus.
VIRUSES-BASEL, 7 (5).
pp. 2727-2744.
ISSN 1999-4915
(2015)
Oláh Péter; Tombácz Dóra; Póka Nándor; Csabai Zsolt; Prazsák István; Boldogkői Zsolt:
Characterization of pseudorabies virus transcriptome by Illumina sequencing.
BMC MICROBIOLOGY, 15.
Terjedelem: 9 p.-Azonosító: 130.
ISSN 1471-2180
(2015)
Tombácz Dóra; Sharon Donald; Oláh Péter; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt:
Strain Kaplan of Pseudorabies Virus Genome Sequenced by PacBio Single-Molecule Real-Time Sequencing Technology.
GENOME ANNOUNCEMENTS, 2 (4).
Terjedelem: 3 p.-Azonosító: e00628.
ISSN 2169-8287
(2014)