Szerző: " Csabai Zsolt"

Tombácz Dóra; Torma Gábor; Gulyás Gábor; Fülöp Ádám; Dörmő Ákos; Prazsák István; Csabai Zsolt; Mizik Máté Levente; Hornyák Ákos; Zádori Zoltán; Kakuk Balázs; Boldogkői Zsolt: Hybrid sequencing discloses unique aspects of the transcriptomic architecture in equid alphaherpesvirus 1.
HELIYON, 9 (7). ISSN 2405-8440 (2023)

Torma Gábor; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Almsarrhad Islam; Nagy Gergely Ármin; Kakuk Balázs; Gulyás Gábor; Spires Lauren McKenzie; Gupta Ishaan; Fülöp Ádám; Dörmő Ákos; Prazsák István; Mizik Máté Levente; Dani Virág Éva; Csányi Viktor; Harangozó Ákos; Zádori Zoltán; Toth Zsolt; Boldogkői Zsolt: Identification of herpesvirus transcripts from genomic regions around the replication origins.
SCIENTIFIC REPORTS, 13 (1). ISSN 2045-2322 (2023)

Kakuk Balázs; Dörmő Ákos; Csabai Zsolt; Kemenesi Gábor; Prazsák István; Dani Virág Éva; Dénes Béla; Torma Gábor; Jakab Ferenc; Tóth Gábor Endre; Földes Fanni Vivien; Zana Brigitta; Lanszki Zsófia; Harangozó Ákos; Fülöp Ádám; Gulyás Gábor; Mizik Máté Levente; Kiss András Attila; Tombácz Dóra; Boldogkői Zsolt: In-depth Temporal Transcriptome Profiling of Monkeypox and Host Cells using Nanopore Sequencing.
SCIENTIFIC DATA, 10 (1). ISSN 2052-4463 (2023)

Torma Gábor; Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Fülöp Ádám; Prazsák István; Csabai Zsolt; Michael Snyder; Boldogkői Zsolt: Dual isoform sequencing reveals complex transcriptomic and epitranscriptomic landscapes of a prototype baculovirus.
SCIENTIFIC REPORTS, 12 (1). ISSN 2045-2322 (2022)

Tombácz Dóra; Dörmő Ákos; Gulyás Gábor; Csabai Zsolt; Prazsák István; Kakuk Balázs; Harangozó Ákos; Jankovics István; Dénes Béla; Boldogkői Zsolt: High temporal resolution Nanopore sequencing dataset of SARS-CoV-2 and host cell RNAs.
GIGASCIENCE, 11. ISSN 2047-217X (2022)

Fülöp Ádám; Torma Gábor; Moldován Norbert; Szenthe Kálmán; Bánáti Ferenc; Almsarrhad Islam A. A.; Csabai Zsolt; Tombácz Dóra; Minárovits János; Boldogkői Zsolt: Integrative profiling of Epstein–Barr virus transcriptome using a multiplatform approach.
VIROLOGY JOURNAL, 19 (1). Terjedelem: 17-Azonosító: 7. ISSN 1743-422X (2022)

Prazsák István; Csabai Zsolt; Torma Gábor; Papp Henrietta; Földes Fanni Vivien; Kemenesi Gábor; Jakab Ferenc; Gulyás Gábor; Fülöp Ádám; Megyeri Klára; Dénes Béla; Boldogkői Zsolt; Tombácz Dóra: Transcriptome dataset of six human pathogen RNA viruses generated by nanopore sequencing.
DATA IN BRIEF, 43. ISSN 2352-3409 (2022)

Torma Gábor; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Mészáros István; Zádori Zoltán; Boldogkői Zsolt: Combined Short and Long-Read Sequencing Reveals a Complex Transcriptomic Architecture of African Swine Fever Virus.
VIRUSES, 13 (4). Terjedelem: 21 p-Azonosító: 579. ISSN 1999-4915 (2021)

Kakuk Balázs; Tombácz Dóra; Balázs Zsolt; Moldován Norbert; Csabai Zsolt; Torma Gábor; Megyeri Klára; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Combined nanopore and single-molecule real-time sequencing survey of human betaherpesvirus 5 transcriptome.
Scientific Reports-Nature, 11 (1). Terjedelem: 14-Azonosító: 14487. (2021)

Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Torma Gábor; Nagy Tibor; Hornyák Ákos; Csabai Zsolt; Gulyás Gábor; Boldogkői Zsolt; Jefferson Victoria A.; Zádori Zoltán; Meyer Florencia; Boldogkői Zsolt: Dynamic Transcriptome Sequencing of Bovine Alphaherpesvirus Type 1 and Host Cells Carried Out by a Multi-Technique Approach.
FRONTIERS IN GENETICS, 12. Terjedelem: 8 p-Azonosító: 619056. ISSN 1664-8021 (2021)

Torma Gábor; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Göbhardter Dániel; Deim Zoltán; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: An Integrated Sequencing Approach for Updating the Pseudorabies Virus Transcriptome.
PATHOGENS, 10 (2). Terjedelem: 21 p-Azonosító: 242. ISSN 2076-0817 (2021)

Kakuk Balázs; Kiss András Attila; Torma Gábor; Csabai Zsolt; Prazsák István; Mizik Máté; Megyeri Klára; Tombácz Dóra; Boldogkői Zsolt: Nanopore Assay Reveals Cell-Type-Dependent Gene Expression of Vesicular Stomatitis Indiana Virus and Differential Host Cell Response.
PATHOGENS, 10 (9). Terjedelem: 12-Azonosító: 1196. ISSN 2076-0817 (2021)

Csáki Ágnes; Köves Katalin; L. Kiss Anna; Röhlich Pál; Boldogkői Zsolt; Vereczki Viktória; Puskár Zita; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt: Pinealocytes can not transport neurotropic viruses. Pinealo-to-retinal connection in prepubertal rats originates from pineal neurons: Light and electron microscopic immunohistochemical studies.
NEUROSCIENCE LETTERS, 744. Terjedelem: 7 p-Azonosító: 135517. ISSN 0304-3940 (2021)

Maróti Zoltán; Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Torma Gábor; Jefferson Victoria A.; Csabai Zsolt; Gulyás Gábor; Dörmő Ákos; Boldogkői Miklós; Kalmár Tibor; Meyer Florencia; Boldogkői Zsolt: Time course profiling of host cell response to herpesvirus infection using nanopore and synthetic long-read transcriptome sequencing.
SCIENTIFIC REPORTS, 11 (1). Terjedelem: 11-Azonosító: 14219. ISSN 2045-2322 (2021)

Tombácz Dóra; Prazsák István; Torma Gábor; Csabai Zsolt; Balázs Zsolt; Moldován Norbert; Dénes Béla; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Time-Course Transcriptome Profiling of a Poxvirus Using Long-Read Full-Length Assay.
PATHOGENS, 10 (8). Terjedelem: 17-Azonosító: 919. ISSN 2076-0817 (2021)

Maróti Zoltán; Tombácz Dóra; Prazsák István; Moldován Norbert; Csabai Zsolt; Torma Gábor; Balázs Zsolt; Kalmár Tibor; Dénes Béla; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Time-course transcriptome analysis of host cell response to poxvirus infection using a dual long-read sequencing approach.
BMC RESEARCH NOTES, 14 (1). Terjedelem: 7-Azonosító: 239. ISSN 1756-0500 (2021)

Boldogkői Zsolt; Csabai Zsolt; Tombácz Dóra; Janovák László; Balassa Lilla; Deák Ágota; S. Tóth Péter; Janáky Csaba; Duda Ernő; Dékány Imre: Visible Light-Generated Antiviral Effect on Plasmonic Ag-TiO2-Based Reactive Nanocomposite Thin Film.
FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY, 9. Terjedelem: 11-Azonosító: 709462. ISSN 2296-4185 (2021)

Tombácz Dóra; Prazsák István; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Dénes Béla; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Long-read assays shed new light on the transcriptome complexity of a viral pathogen.
SCIENTIFIC REPORTS, 10 (1). Terjedelem: 13 p-Azonosító: 13822. ISSN 2045-2322 (2020)

Olasz Ferenc; Tombácz Dóra; Torma Gábor; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Dörmő Ákos; Prazsák István; Mészáros István; Magyar Tibor; Tamás Vivien; Zádori Zoltán; Boldogkői Zsolt: Short and Long-Read Sequencing Survey of the Dynamic Transcriptomes of African Swine Fever Virus and the Host Cells.
FRONTIERS IN GENETICS, 11. Azonosító: 758-Terjedelem: 7 p. ISSN 1664-8021 (2020)

Moldován Norbert; Torma Gábor; Gulyás Gábor; Hornyák Ákos; Zádori Zoltán; Jefferson Victoria A.; Csabai Zsolt; Boldogkői Miklós; Tombácz Dóra; Meyer Florencia; Boldogkői Zsolt: Time-course profiling of bovine alphaherpesvirus 1.1 transcriptome using multiplatform sequencing.
SCIENTIFIC REPORTS, 10 (1). Terjedelem: 14 p.-Azonosító: 20496. ISSN 2045-2322 (2020)

Csabai Zsolt; Tombácz Dóra; Deim Zoltán; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Analysis of the Complete Genome Sequence of a Novel, Pseudorabies Virus Strain Isolated in Southeast Europe.
CANADIAN JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES & MEDICAL MICROBIOLOGY, 2019. Paper 1806842-12 p. ISSN 1712-9532 (2019)

Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Balázs Zsolt; Gulyás Gábor; Csabai Zsolt; Boldogkői Miklós; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Multiple Long-read Sequencing Survey of Herpes Simplex Virus Dynamic Transcriptome.
FRONTIERS IN GENETICS, 10. Azonosító: 834 -Terjedelem: 20 p. ISSN 1664-8021 (2019)

Balázs Zsolt; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Template-switching artifacts resemble alternative polyadenylation.
BMC Genomics, 20. Azonosító: 824-Terjedelem: 10 p. ISSN 1471-2164 (2019)

Tombácz Dóra; Balázs Zsolt; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Long-read sequencing revealed an extensive transcript complexity in herpesviruses.
FRONTIERS IN GENETICS, 9. Terjedelem: 6 p.-Közleményazonosító: 259. (2018)

Prazsák István; Moldován Norbert; Balázs Zsolt; Tombácz Dóra; Megyeri Klára; Szűcs Attila; Csabai Zsolt; Boldogkői Zsolt: Long-read sequencing uncovers a complex transcriptome topology in varicella zoster virus.
BMC GENOMICS, 19 (1). Paper 873.-20 p.. ISSN 1471-2164 (2018)

Moldován Norbert; Szűcs Attila; Tombácz Dóra; Balázs Zsolt; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Multi-platform next-generation sequencing identifies novel RNA molecules and transcript isoforms of the endogenous retrovirus isolated from cultured cells.
FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 365 (5). Terjedelem: 6 p.-Azonosító: fny013. ISSN 0378-1097 (2018)

Moldován Norbert; Tombácz Dóra; Szűcs Attila; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Multi-platform sequencing approach reveals a novel transcriptome profile in pseudorabies virus.
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 8. Terjedelem: 13 p.-Azonosító: 2708. ISSN 1664-302X (2018)

Moldován Norbert; Tombácz Dóra; Szűcs Attila; Csabai Zsolt; Balázs Zsolt; Kis Emese; Molnár Judit; Boldogkői Zsolt: Third-generation sequencing reveals extensive polycistronism and transcriptional overlapping in a baculovirus.
SCIENTIFIC REPORTS, 8 (1). Terjedelem: 11 p.-Azonosító: 8604. ISSN 2045-2322 (2018)

Tombácz Dóra; Balázs Zsolt; Csabai Zsolt; Moldován Norbert; Szűcs Attila; Sharon Donald; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Characterization of the Dynamic Transcriptome of a Herpesvirus with Long-read Single Molecule Real-Time Sequencing.
SCIENTIFIC REPORTS, 7. ISSN 2045-2322 (2017)

Póka Nándor; Csabai Zsolt; Pásti Emese; Tombácz Dóra; Boldogkői Zsolt: Deletion of the us7 and us8 genes of pseudorabies virus exerts a differential effect on the expression of early and late viral genes.
VIRUS GENES, 53 (4). pp. 603-612. ISSN 0920-8569, 1572-994X (2017)

Csabai Zsolt; Takács Irma; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt; Tombácz Dóra: Evaluation of the impact of ul54 gene-deletion on the global transcription and DNA replication of pseudorabies virus.
ARCHIVES OF VIROLOGY, 162 (9). pp. 2679-2694. ISSN 0304-8608 (2017)

Tombácz Dóra; Moldován Norbert; Balázs Zsolt; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Genetic Adaptation of Porcine Circovirus Type 1 to Cultured Porcine Kidney Cells Revealed by Single-Molecule Long-Read Sequencing Technology.
GENOME ANNOUNCEMENTS, 5 (5). e01539-16-2 p.. ISSN 2169-8287 (2017)

Tombácz Dóra; Maróti Zoltán; Kalmár Tibor; Csabai Zsolt; Balázs Zsolt; Takahashi Shinichi; Palkovits Miklós; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: High-coverage whole-exome sequencing identifies candidate genes for suicide in victims with major depressive disorder.
SCIENTIFIC REPORTS, 7 (1). Terjedelem: 11 p-Azonosító: 7106. ISSN 2045-2322 (2017)

Balázs Zsolt; Tombácz Dóra; Szűcs Attila; Csabai Zsolt; Megyeri Klára; Petrov Alexey N.; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Long-read sequencing of human cytomegalovirus transcriptome reveals RNA isoforms carrying distinct coding potentials.
SCIENTIFIC REPORTS, 7. Azonosító: 15989-Terjedelem: 9 p.. ISSN 2045-2322 (2017)

Szűcs Attila; Moldován Norbert; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Long-read sequencing reveals a GC pressure during the evolution of porcine endogenous retrovirus.
GENOME ANNOUNCEMENTS, 5 (40). Azonosító: e01040-terjedelem: 2 p. (2017)

Moldován Norbert; Balázs Zsolt; Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Szűcs Attila; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Multi-platform analysis reveals a complex transcriptome architecture of a circovirus.
VIRUS RESEARCH, 237. pp. 37-46. ISSN 0168-1702 (2017)

Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Oláh Péter; Balázs Zsolt; Likó István; Zsigmond Laura; Sharon Donald; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Full-Length Isoform Sequencing Reveals Novel Transcripts and Substantial Transcriptional Overlaps in a Herpesvirus.
PLoS ONE, 11 (9). Terjedelem: 29 p.-Azonosító: e0162868. ISSN 1932-6203 (2016)

Tombácz Dóra; Csabai Zsolt; Oláh Péter; Havelda Zoltán; Sharon Donald; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Characterization of novel transcripts in pseudorabies virus.
VIRUSES-BASEL, 7 (5). pp. 2727-2744. ISSN 1999-4915 (2015)

Oláh Péter; Tombácz Dóra; Póka Nándor; Csabai Zsolt; Prazsák István; Boldogkői Zsolt: Characterization of pseudorabies virus transcriptome by Illumina sequencing.
BMC MICROBIOLOGY, 15. Terjedelem: 9 p.-Azonosító: 130. ISSN 1471-2180 (2015)

Tombácz Dóra; Sharon Donald; Oláh Péter; Csabai Zsolt; Snyder Michael; Boldogkői Zsolt: Strain Kaplan of Pseudorabies Virus Genome Sequenced by PacBio Single-Molecule Real-Time Sequencing Technology.
GENOME ANNOUNCEMENTS, 2 (4). Terjedelem: 3 p.-Azonosító: e00628. ISSN 2169-8287 (2014)